Os programas são propostas de intervenção centrada nas necessidades inicialmente identificadas pelo solicitador do pedido ou por familiares ou representantes institucionais. Este programa tem em conta os actuais conhecimentos e práticas de intervenção em musicoterapia, sendo aplicados por musicoterapeutas certificados. 

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Este programa de intervenção terá em conta o contexto, as necessidade(s) do(s) participante(s), a duração, o horário, o tipo de intervenção (individual ou de grupo) e a avaliação de impacto.

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A duração mínima de um programa de intervenção é de três meses. Poderá haver lugar para programas intensivos em época de férias escolares ou laborais. A elaboração de relatórios de intervenção acresce um custo extra.